аЯрЁБс>ўџ 79ўџџџ6џџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџьЅСq` јП0)bjbjqPqP :::)џџџџџџЄ*R R R R f $*›І– (О О О О О >ќ  $AhЉV@k О О k k @О О Uзззk О О зk зз:R,кО Š А6v ХЂШR }.~ і$k0›ˆRџЋ"џкџк 0L "зn Š с   @@Э    ›k k k k ***ф D*** ***џџџџ  Exercise-V  In this session we will use the following web sites: National Center for Biotechnology Information:  HYPERLINK "http://www.ncbi.nlm.nih.gov" www.ncbi.nlm.nih.gov (BLAST) EMBnet Switzerland:  HYPERLINK "http://www.ch.embnet.org" www.ch.embnet.org (LALIGN) Align two protein sequences with local and global alignment, find out the most conserved motif between them: "THEFASTCATCATCHESAFATRAT" and "THEFATCATCATCHESADEADRAT" Suppose we have two protein sequences: "AREALFRIENDISAFRIENDINNEED" and "AFRIENDINNEEDISAFRIENDINDEED" Is these any sequence repeat(s) in each peptide? Are there any conserved domain between the two peptides? Are these two peptides homologues? Make local and global sequence alignment between the protein sequnce of Human alpha globin (P69905) and human beta globin (P68871), compare the results Make local and global sequence alignment between the protein sequnce of Huaman alpha globin (P69905) and Yellow lupine leghemoglobin (P02240), compare the results Make local and global sequence alignment between the protein sequnce of Huamna alpha globin (P69905) and Nemotode glutathione S-transferase (P91253), compare the results Make local and global sequence alignment for the protein sequnce of PPF1_PEA and ALB3_ARATH, compare the results Make local and global sequence alignment for the coding sequnce of Y12618 and ATU89272, compare the results Make sequence alignment between the Rice histidine transporter (CAD89802) and Arabidopsis lysine and histidine transporter(AAC49885) Align two simple peptides by either local or global alignment, change scoring matrix and gap penalty to see the results: "AFATCAT" and "AFASTCAT" Align the yeast hexokinase A and yeast hexokinase B 1. cDNAs 2.protein. Compare the results and elaborate on the differences. %EGvw ЁЂЖЗПРдећљымЪљПыљЛљЊ•Њ}•j•\ЊG•G(hC€hC€CJOJQJ^JaJmHsHhC€CJOJQJ^JaJ$hŽ|NhC€0JCJOJQJ^JaJ/jЂhŽ|NhC€CJOJQJU^JaJ)jhŽ|NhC€CJOJQJU^JaJ hŽ|NhC€CJOJQJ^JaJhC€jhŽ|NhC€U"hŽ|NhC€5CJOJQJ\aJhC€5CJOJQJ\aJhŽ|NhC€5OJQJ\ hŽ|NhC€GР  С Т У * іііііічбЙЂ“‹‹ƒ & FgdC€$A$gdC€$ & F„„ A$gdC€$„Ьў„hЄdЄdA$[$\$]„Ьў^„hgdC€$ & F„Ьў„аЄdЄdA$[$\$]„ЬўgdC€$ & F„„аЄdЄdA$[$\$gdC€$ЄdЄdA$[$\$gdC€ $A$a$gdC€)ўћќ§   + , )чвЛвІ›Œ›hC€hC€B*CJaJphџhC€hC€CJaJ(hC€hC€CJOJQJ^JaJmHsH,hC€hC€0JCJOJQJ^JaJmHsH)jhŽ|NhC€CJOJQJU^JaJ/j{hŽ|NhC€CJOJQJU^JaJ* , - . _ ` a š › œ П Р С Y Z § њюпЯЯПЏЏЏЏюю•dhgdC€$ & F„„ dhA$gdC€$„ „hA$^„ `„hgdC€$„„hA$^„`„hgdC€$„8„аA$^„8`„аgdC€$ & F„„ A$gdC€ $„8A$^„8gdC€gdC€§ ў Ј Љ  ‡ ˆ Ÿ ЁЂзя№&'(№ооооооогЫЫМЌЫМ   $„8A$^„8gdC€$„8„hA$^„8`„hgdC€$ & F„„ A$gdC€$A$gdC€ $dhA$gdC€$ & F„„ dhA$gdC€$„8dhA$^„8gdC€()ј$„„81h:pC€А‚. АЦA!А„"Аž#7$n%ААХАХ Ф(2*2ЂDdшєr <№V № 3 №ЌЈ™ПџC"ё”•–r П((№€йDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ www.ncbi.nlm.nih.govрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ :http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ЭDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ www.ch.embnet.orgрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ 4http://www.ch.embnet.org/†œN`ёџN C€Normal$„„A$CJ_HaJmH sH tH DA@ђџЁD Default Paragraph FontRiѓџГR  Table Normalі4ж l4жaі (kєџС(No List4U`Ђё4 C€ Hyperlink >*phџœўoœ C€HTML Preformatted1=$ Ц2”(М Pфx  4 Ш#\'№*„.2Ќ5@9A$ CJOJPJQJ^JaJnHtHŽe`Ž C€HTML Preformatted=$ Ц2”(М Pфx  4 Ш#\'№*„.2Ќ5@9A$CJOJQJ^JaJ)џџџџGРСТУ*,-._`aš›œПРСYZ§ўЈЉ‡ˆ Ÿ ЁЂзя№&'(+˜0€€€˜0€€€˜0€€€˜0€€€˜0€€€˜0€€€˜0€€€˜ 0€€€˜ 0€€˜0€€˜ 0С€˜0€€˜0€€˜ 0€€˜0€€˜0€€˜ 0С€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜0€€˜ 0С€˜0€€˜ 0С€˜0€€˜ 0С€˜ 0С€˜ 0С€˜ 0С€˜ 0С€˜ 0 С€˜ 0 С€˜0€€˜0€€˜0€€˜ 0 С€˜0€€˜0€€˜ 0 С€˜0€€˜0€€˜0€€,+jЫ00€ 00Зћ) * § () ) vЁЖдќ)Xџ„Xџ„џџ _Hlt164664102 _Hlt164584456Ў+@@Џ+џџ…QŒз#†Qфь‡QФІGGP+OVV+9*€urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags€place€=*€urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags €PlaceName€=*€urn:schemas-microsoft-com:office:smarttags €PlaceType€ *ЄРд§ў4:—žЂЈЏЕбо;BFLSYgo~‰тщSZБКэіВМЩгкп+Рaкп+33з№++&%œgрИ.џџџџџџџџџ…hТjВAЂыџџџџџџџџџh„а„˜ўЦа^„а`„˜ў>*CJOJQJ^Jo(.h„ „˜ўЦ ^„ `„˜ў>*CJOJQJo(‡hˆHЗ№‚ „p„LџЦp^„p`„Lџ‡hˆH.€ „@ „˜ўЦ@ ^„@ `„˜ў‡hˆH.€ „„˜ўЦ^„`„˜ў‡hˆH.‚ „р„LџЦр^„р`„Lџ‡hˆH.€ „А„˜ўЦА^„А`„˜ў‡hˆH.€ „€„˜ўЦ€^„€`„˜ў‡hˆH.‚ „P„LџЦP^„P`„Lџ‡hˆH.h„а„˜ўЦа^„а`„˜ўOJQJo(‡hˆHЗ№h„ „˜ўЦ ^„ `„˜ўOJQJ^Jo(‡hˆHoh„p„˜ўЦp^„p`„˜ўOJQJo(‡hˆHЇ№h„@ „˜ўЦ@ ^„@ `„˜ўOJQJo(‡hˆHЗ№h„„˜ўЦ^„`„˜ўOJQJ^Jo(‡hˆHoh„р„˜ўЦр^„р`„˜ўOJQJo(‡hˆHЇ№h„А„˜ўЦА^„А`„˜ўOJQJo(‡hˆHЗ№h„€„˜ўЦ€^„€`„˜ўOJQJ^Jo(‡hˆHoh„P„˜ўЦP^„P`„˜ўOJQJo(‡hˆHЇ№&%œg…hТjџџџџџџџџџџџџцQ6Ž                 хC€ˆ +џ@€440АЃбб44)P@џџUnknownџџџџџџџџџџџџG‡z €џTimes New Roman5€Symbol3& ‡z €џArial7‡ŸGeorgia?5 ‡z €џCourier New;†SimSun‹[SO;€Wingdings"qˆ№аhіЂФЃФ  !№„7ДД24&& 2ƒQ№HP)№џ?фџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџC€2џџ Exercise-Vshefaashefaa  ўџр…ŸђљOhЋ‘+'Гй0p˜ЌИШдр№   , 8 DPX`hф Exercise-VshefaaNormalshefaa1Microsoft Office Word@Є“ж@D;ФЂШ@шЮщФЂШўџеЭеœ.“—+,љЎDеЭеœ.“—+,љЎ8є hp|„Œ” œЄЌД М гф &ц  Exercise-V Title$ 8@ _PID_HLINKSфAм http://www.ch.embnet.org/$ NLhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/$  ўџџџўџџџ !"#$%ўџџџ'()*+,-ўџџџ/012345ўџџџ§џџџ8ўџџџўџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџRoot Entryџџџџџџџџ РF b} ХЂШ:€Data џџџџџџџџџџџџ1TableџџџџWordDocumentџџџџ:SummaryInformation(џџџџџџџџџџџџ&DocumentSummaryInformation8џџџџџџџџ.CompObjџџџџџџџџџџџџqџџџџџџџџџџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџўџ џџџџ РFMicrosoft Office Word Document MSWordDocWord.Document.8є9Вq